Les études doctorales sont considérées à l’ENS comme la dernière étape de l’approfondissement de la formation par la recherche, une formation à l’innovation et à la créativité ainsi qu’à la réalisation de projets.
Les doctorants de l’ENS bénéficient non seulement d’un très bon encadrement mais aussi d’une formation doctorale complémentaire avec un enseignement adapté, des séminaires de recherche et des stages à l’étranger.
L’ENS participe à la gestion de diverses écoles doctorales en accréditation partagée avec d’autres universités et établissements d’enseignement supérieur.
Cependant, de nombreuses thèses sont effectuées dans le cadre d’autres écoles doctorales, en région parisienne ou en province.